Retribuciones puestos de habilitación foral

Realizándose la habilitación de los puestos de Secretaría e Intervención desde el Gobierno de Navarra, y teniendo todos las mismas funciones, ya que las marcará la futura Ley Foral de Administración Local, ¿no sería más lógico que se aplicara el principio de "a igual trabajo igual retribución"? Se trata de puestos de trabajo en los que la independencia es fundamental para el correcto ejercicio de sus funciones, y desde el momento en el que las retribuciones son fijadas en la entidad local en el que el habilitado trabaja, ésta se pierde. ¿Cómo es posible que existan diferencias tan elevadas entre entidades locales de características similares?